Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAK2O60296 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms