Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ3O43525 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms