Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms