Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNJ2O15056 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SYNJ2O15056 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYNJ2O15056 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms