Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLRMTO00411 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLRMTO00411 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms