Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARVCFO00192 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARVCFO00192 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARVCFO00192 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms