Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF225M0QZC1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF225M0QZC1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF225M0QZC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms