Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L12C9JPN9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP17L12C9JPN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L12C9JPN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L12C9JPN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L12C9JPN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms