Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms