Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf172C9J069 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms