Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3P2A8K0S8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms