Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms