Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms