Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC154A6NI56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms