Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNDIG1LA6NDD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms