Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF22A3QJZ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF22A3QJZ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF22A3QJZ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms