Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA8A3KMH1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms