Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC78A2IDD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms