Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TCRBV5S2A0A599 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TCRBV5S2A0A599 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCRBV5S2A0A599 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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TCRBV5S2A0A599 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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