Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20-1A0A075B6N2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV20-1A0A075B6N2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20-1A0A075B6N2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms