Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms