Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms