Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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