Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms