Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP13-4Q3LI77 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms