Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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