Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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