Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms