Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms