Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms