Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms