Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MARCKSP29966 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms