Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCP1P17987 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCP1P17987 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCP1P17987 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms