Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFP17480 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFP17480 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms