Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRAFP15056 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRAFP15056 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRAFP15056 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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BRAFP15056 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BRAFP15056 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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