Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VTNP04004 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VTNP04004 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VTNP04004 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms