Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms