Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF6Q9Y4K3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRAF6Q9Y4K3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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