Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP89Q96ST8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms