Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms