Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms