Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms