Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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