Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIRAP54198 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIRAP54198 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms