Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDSP20132 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDSP20132 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDSP20132 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDSP20132 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDSP20132 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDSP20132 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDSP20132 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms