Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRAMEF22A3QJZ6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms