Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN18Q99952 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms