Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms