Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms