Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms